Научные коллективы, с которыми кафедра проводит совместные исследования:

• Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН (Москва)
- лаборатория стереохимии ферментативных реакций
• Институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН (Москва)
  - лаборатория структурно-функционального конструирования лекарств
  - лаборатория молекулярно-графического конструирования лекарств
  
• Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН (Москва)
- лаборатория математической химии и компьютерного синтеза
- лаборатория азотсодержащих гетероциклических соединений

• Саратовский государственный университет
- кафедра органической и биоорганической химии
• Физический институт РАН (Самара)
- лаборатория технологических лазеров
• Самарский государственный технологический университет
- кафедра органической химии
• Самарский государственный медицинский университет
- кафедра фармацевтической технологии
- кафедра химии фармацевтического факультета
• Самарский государственный университет путей сообщения
• Химический факультет Самарского государственного университета
- кафедра физической химии и хроматографии
• Биологический факультет Самарского государственного университета
- кафедра биологической химии
- кафедра физиологии человека и животных
- кафедра зоологии, генетики и общей экологии