MacMolPlt  

Программа для отображения трехмерных молекулярных структур и мод нормальных колебаний. Допускает чтение различных файловых форматов, включая файлы ввода GAMESS (*.inp), log-файлы или IRC-файлы непосредственно для создания анимаций IRC- и DRC-типа и оптимизаций. Можно также импортировать группу $VEC-группу из любого файла (такого, как GAMESS.DAT). Кроме того, поддерживаются файлы форматов xMol XYZ, MolDen и химический язык разметки (CML). Включена также некоторая поддержка PDB и MolFile MDL Mol файлов. Поддерживаются молекулярные точечные группы симметрии молекул. Возможны двумерное отображение орбиталей, контурной карты электронной плотности и трехмерное отображение молекулярных орбиталей, полной или разностной электронной плотности, молекулярного электростатического потенциала. Имеется простой конструктор для создания входных файлов (*.inp) к программе GAMESS.

http://www.uni-smr.ac.ru/archive/win/science/chem/Avogadro/avogadro-1.0.1-python-win32.exe

http://www.uni-smr.ac.ru/archive/win/science/chem/Arguslab_4.0.1/setup.exe

http://www.uni-smr.ac.ru/archive/win/science/chem/ACDLabs_12_free/chemsk12.exe

ISIS/Draw (draw24.exe,     help24.exe,    русификатор программы)

Программа для рисования химических структур, созданная MDL Information Systems для операционных систем семейства Windows. Программа бесплатна для академического и индивидуального использования. Она используется как основа для ISIS/Base – программы химической базы данных и ряда других той же самой компании. ISIS/Draw использует собственный формат файла с расширением .skc, а также поддерживает стандартные химические форматы файлов, такие как MDL molfile, Rxnfile и TGfile. Программа ISIS/Draw будучи, главным образом, двухмерным графическим редактором, имеет некоторые функции трехмерного вращения и может взаимодействовать с Rasmol для трехмерной визуализации и рендеринга структур. ISIS/Draw также включает возможность проверки правильности структур и реакций и может вычислять элементарные свойства, такие как брутто-формула и молекулярная масса.

МОХ (скачать)

Программа (А. Скугарев, СамГУ) предназначена для расчёта несложных молекул, ионов и радикалов по методу Хюккеля в π-электронном приближении. Позволяет находить вековые детерминанты и полиномы, выражения π-молекулярных орбиталей в виде линейной комбинации атомных орбиталей. Определяет энергию молекулярных орбиталей и полную π-электронную энергию молекул, ионов и радикалов. Производит построение молекулярных диаграмм, включающих порядки связей, электронную плотность на атомах и индексы свободной валентности. Может использоваться для определения энергий локализации атомов при электрофильной, нуклеофильной или радикальной атаке молекулы.

Назад